Na maioria dos casos, o grau de contaminação da água por germes não é visível a olho nu. Um copo de água pode conter vários milhares a vários milhões de germes e ainda assim parecer limpo. Sem um laboratório totalmente equipado, a contaminação por germes só pode ser estimada. Além disso, temperaturas acima de 21 graus Celsius podem reduzir significativamente a eficácia da solução de dióxido de cloro. Para excluir de forma fiável a contaminação residual por germes, na prática, o cloro é frequentemente sobredosado. Isto pode atingir duas a dez vezes os valores indicados na tabela. Está comprovado que isto não tem efeitos secundários para a saúde. O dióxido de cloro, como princípio ativo, decompõe-se em água inofensiva, oxigénio e uma quantidade mínima de sal de cozinha ou escapa parcialmente para o ambiente (desgaseificação). Por isso, especialmente no caso de grandes quantidades de água e dosagens elevadas, deve-se sempre trabalhar em salas bem ventiladas.